Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Smim12Q78RX3 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms