Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Higd1cQ76I25 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms