Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc88cQ6VGS5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
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