Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.63
GcsamQ6RFH4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
GcsamQ6RFH4 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms