Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHS6

Snx13, Sorting nexin-13, mousemouse

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Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx13Q6PHS6 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx13Q6PHS6 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx13Q6PHS6 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx13Q6PHS6 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx13Q6PHS6 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx13Q6PHS6 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx13Q6PHS6 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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