Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtifQ6PEE2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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