Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trak1Q6PD31 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trak1Q6PD31 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms