Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Q6DFW0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q6DFW0 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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