Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pdzrn3Q69ZS0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pdzrn3Q69ZS0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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