Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

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Length 577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Msl2Q69ZF8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Msl2Q69ZF8 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Msl2Q69ZF8 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms