Protein–RNA interactions for Protein: Q62318

Trim28, Transcription intermediary factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim28Q62318 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim28Q62318 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim28Q62318 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim28Q62318 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim28Q62318 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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