Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itga6Q61739 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itga6Q61739 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itga6Q61739 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 465.9 ms