Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Klf3Q60980 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms