Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rbbp7Q60973 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms