Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rbbp4Q60972 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms