Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tdrd5Q5VCS6 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Tdrd5Q5VCS6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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