Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Bbs12Q5SUD9 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Bbs12Q5SUD9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms