Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Ccdc185Q3V118 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms