Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp48Q3V0C5 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp48Q3V0C5 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp48Q3V0C5 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp48Q3V0C5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp48Q3V0C5 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp48Q3V0C5 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp48Q3V0C5 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Usp48Q3V0C5 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp48Q3V0C5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Usp48Q3V0C5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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