Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Kdm5aQ3UXZ9 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Kdm5aQ3UXZ9 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm5aQ3UXZ9 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm5aQ3UXZ9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kdm5aQ3UXZ9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kdm5aQ3UXZ9 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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