Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm6899Q3USS0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms