Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Dctd-205ENSMUST00000174278 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm21190-202ENSMUST00000196384 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Gm21149-201ENSMUST00000197995 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Znf48Q3US17 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Znf48Q3US17 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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