Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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D13Ertd608eQ3UPR8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
D13Ertd608eQ3UPR8 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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