Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Q3U595 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms