Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Ssbp4Q3U4B1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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