Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Trappc9Q3U0M1 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms