Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Usp39Q3TIX9 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Usp39Q3TIX9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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