Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atp2b3Q0VF55 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms