Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Tff1Q08423 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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