Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cnn1Q08091 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cnn1Q08091 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms