Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
MestQ07646 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
MestQ07646 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
MestQ07646 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms