Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Col9a2Q07643 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms