Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Cdx4Q07424 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms