Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Cntn3Q07409 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Atg10-201ENSMUST00000022119 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cntn3Q07409 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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