Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gdf3Q07104 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms