Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm8023-201ENSMUST00000195298 903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm43036-201ENSMUST00000200594 373 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm28929-201ENSMUST00000185330 1193 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm29243-201ENSMUST00000188318 418 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm36371-201ENSMUST00000209043 1103 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 AV026068-225ENSMUST00000225042 490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 1700023G09Rik-201ENSMUST00000194513 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Vmn1r27-201ENSMUST00000095862 912 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Sox12Q04890 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms