Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm18706-201ENSMUST00000210053 1066 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Nf1Q04690 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Nf1Q04690 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms