Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Col1a2Q01149 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms