Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dchs2-201ENSMUST00000191829 10783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Dysf-215ENSMUST00000204591 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Car12-201ENSMUST00000071889 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Cited1P97769 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm12576-201ENSMUST00000135268 3036 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Actr2-201ENSMUST00000000137 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rdh9-201ENSMUST00000052652 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Zic3-201ENSMUST00000088627 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Cited1P97769 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms