Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smarcc1P97496 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcc1P97496 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms