Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Irx1P81068 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms