Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou3f4P62515 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms