Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Dpf3P58269 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms