Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxc13P50207 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxc13P50207 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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