Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtpreP49446 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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PtpreP49446 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PtpreP49446 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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