Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfx1P48377 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rfx1P48377 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rfx1P48377 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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