Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

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Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Epb41P48193 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Epb41P48193 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Epb41P48193 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Epb41P48193 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Epb41P48193 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Epb41P48193 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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