Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
SrprbP47758 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
SrprbP47758 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms