Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ptk2P34152 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ptk2P34152 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ptk2P34152 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ptk2P34152 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ptk2P34152 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ptk2P34152 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms