Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Hoxc5P32043 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms